Institutas įsteigtas 1957 m gegužės mėn. Kaune kaip Respublikinė pienininkystės tyrimų laboratorija. 1958 m. liepos mėn. l d. virto Sąjunginio sviesto ir sūrių pramonės mokslinio tyrimo instituto filialu. 1991 m. birželio 21 d. LR Vyriausybės nutarimu Nr. 245 įkurtas Lietuvos maisto institutas (LMaI). Jo veikla buvo nukreipta svarbiausioms Lietuvos maisto produktų gamybos problemoms spręsti, mokslinėms, praktinėms ir metodinėms paslaugoms teikti. Palaipsniui buvo plečiama instituto specializacija, siekiama aukštesnės mokslinių tyrimų kokybės ir integracijos su aukštosiomis mokyklomis. 2001 m. balandžio 4 d. LR Vyriausybės nutarimu reorganizuotas į valstybinę mokslo įstaigą ir instituto steigėjo funkcijas pavesta vykdyti KTU. 2001 m. kartu su Biotechnologijos institutu (Danija), vykdytas projektas, kurio metu buvo pasiruošta bandymų laboratorijos akreditacijai bei juslinės analizės laboratorijų sukūrimui Lietuvoje. 2002 m. Lietuvos nacionalinis akreditacijos biuras akreditavo Instituto Bandymų laboratoriją pagal LST EN ISO/IEC 17025 reikalavimus atlikti maisto produktų fizikinius cheminius ir mikrobiologinius bandymus. 2003 m. balandžio 1 d. LR Vyriausybės nutarimu Nr. 389 valstybės mokslo įstaiga Lietuvos maisto institutas pertvarkytas į universiteto mokslo institutą KTU Maisto institutą ir patvirtintos pagrindinės Instituto veiklos kryptys: maisto kokybės ir saugos valdymo ir užtikrinimo sistemų moksliniai tyrimai; geros kokybės ir sveiko maisto technologijų moksliniai tyrimai. 2016 m. institutas perkeltas į KTU miestelį.
Daugiau apie Maisto instituto veiklą: https://maistas.ktu.edu/
