Pedagoginė ir administracinė veikla Kauno politechnikos institute
1952 m. Česlovas Jakimavičius pradėjo dėstyti Kauno politechnikos institute. 1957 m. Lietuvos žemės ūkio akademijoje apgynė disertaciją „Elektrometalizacinės apsauginės dangos ir jų naudojimo galimybės maisto pramonės įrengimams“ ir jam buvo suteiktas technikos mokslų kandidato laipsnis (1993 m. nostrifikuotas į technikos mokslų daktaro). 1958 m. gegužę Č. Jakimavičius paskirtas Mechanikos fakultete įkurto Medienos mechaninio apdirbimo kabineto vedėju. 1960 m. sausio 1 d. kabinetas buvo perorganizuotas į Medienos mechaninės technologijos katedrą, kurios pirmuoju vedėju Č. Jakimavičius buvo iki 1967 m. 1961 m. jis tapo docentu. 1957–1962 m. Č. Jakimavičius dirbo Mechanikos fakulteto prodekanu, o 1962–1964 m. – Lengvosios pramonės fakulteto dekanu. 1964–1987 m. jis buvo KPI prorektorius mokymo reikalams. 1984 m. Č. Jakimavičius tapo profesoriumi. Č. Jakimavičius buvo geras pedagogas, veiklus mokymo proceso organizatorius, aktyviai rengė mokymo metodinę literatūrą. Išleido medienos paskaitų konspektus: „Medienos sandara“ (1981 m.), „Medienos mechaninės savybės“ (1982 m.), „Medienos fizinės savybės“ (1983 m.), „Medienos ydos“ (1983 m.), taip pat „Studento žinyną“ (1971 m.), „Pirmakursio vadovą“ (kartu su kitais, 1982 m.). Spaudoje paskelbė daugiau kaip 50 straipsnių apie mokymo proceso organizavimą, profesinį orientavimą, studentų auklėjimą. Kartu su kitais 1971–1976 m. sukūrė ir įdiegė KPI mokymo proceso automatizuotą informacinę sistemą. Svarus Č. Jakimavičiaus indėlis ir tyrinėjant elektrometalizacines dangas ir galimybes jas panaudoti maisto pramonės įrengimams – buvo vieno išradimo autorius. 1974 m. už nuopelnus moksliniame ir mokymo organizaciniame darbe jam buvo suteiktas Lietuvos SSR nusipelniusio mokslo ir technikos veikėjo vardas.